几十年来，我们的聚会地点几经更换，始终没有固定的场所。1989年，经厦门市宗教局批准，本会加入厦门市基督教两会，由厦门市宗教局和厦门市基督教两会安排，临时借用竹树堂旁一间可容一百多人的会议室为聚会场所，从此，每安息日众信徒可在此共同敬拜独一真神。

1994年，教会信徒人数增加，原聚会场所无法容纳。适逢国家落实宗教政策，原先被工厂占用的厦港堂归还教会，并将产权登记厦门市基督教两会名下。经市宗教局和市基督教两会批准，安排我会筹资翻修并使用厦港堂的教堂。

1995年1月厦港堂翻建工程竣工，同月即献堂正式投入使用，此后，信徒由竹树堂移至厦港堂聚会。

1998年12月28日，厦港堂正式注册登记为宗教活动场所，定名为：厦门厦港基督教堂。

2018年3月，因存在安全隐患，我们对厦港堂进行二次重修，于2018年9月竣工。